Descripción breve: Se realizará una revisión básica del uso de dinámica molecular con potenciales empíricos en proteínas para estudiar fenómenos en la escala de tiempo de ns-us, para luego concebir la introducción de aproximaciones de grano grueso y de potenciales energéticos simplificados con el fin de extender la escala de tiempo hacia los us-ms, en la cual ocurren las reacciones de plegamiento proteico, asociación proteína-proteína y cambios conformacionales asociados al desempeño biológico. Durante el trabajo práctico se realizarán dos ejercicios de preparación, ejecución y análisis de simulaciones de plegamiento proteico y cambio conformacional, utilizando el software libre GROMACS.
Tutor: Dr. César A. Ramírez-Sarmiento.
Sábado 14 de Noviembre 9:00 – 18:00.
Casa Central de la Pontificia Universidad Católica de Chile, Sala Zócalo 2 (Ubicación: http://rsg-chile.iscbsc.org/blog/2015/09/01/sala-cursos-rsg-en-la-casa-central-puc/).
